目的：通过16S rDNA测序试验研究湿热下注型肛瘘患者手术前后瘘管和肛管局部菌群的变化及其与未患肛瘘健康人群的菌群差异。方法：选取2020年6月至12月于上海中医药大学附属曙光医院肛肠科就诊并接受手术治疗的湿热下注型肛瘘患者，依据肛瘘位置不同分为高位肛瘘组和低位肛瘘组，两组各10例，未患肛瘘的健康人群10例纳入无肛瘘组，通过采集肛瘘患者术中瘘管分泌物，术前、术后肛管分泌物及未患肛瘘健康人群的肛管内分泌物，运用16S rDNA测序结合生物信息学分析，使用细菌群落多样性算法(OUT聚类、Alpha多样性)，分析各组别、各时期的菌群特点，并进行功能富集。结果：无肛瘘组群落丰富度和多样性均最低；术前高位肛瘘组的群落丰富度和多样性均高于低位肛瘘组；瘘管分泌物的群落丰富度和多样性均高于同组病例肛管分泌物。结论：肛瘘患者肠道菌群丰富度及多样性均高于健康人群，瘘管内菌群丰富度及多样性均高于肛管，术后肛瘘患者肛管内菌群丰富度及多样性下降，但仍较健康人群高。

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